Dentysta Krakow
Uslugi dentystyczne w krakowie – stomatolog

Genomowe i epigenomiczne krajobrazy dorosłych z ostrą białaczką szpikową AD 6

Posted in Uncategorized  by admin
July 10th, 2018

Spośród tych 7 próbek, 4 miało mutacje w miR-142, które były zlokalizowane w regionie nasion dojrzałej nici (sekwencja z regionu 3 nazywanego miR-142-3p) i prawdopodobnie wpływały na specyficzność docelową RNA informacyjnego (mRNA) (Rys. S5A w Dodatku uzupełniającym). Uważa się, że ekspresja miR-142-3p i miR-142-5p (sekwencja z regionu 5 ) jest ograniczona głównie do przedziału krwiotwórczego.21,22 Dane z sekwencjonowania miRNA wykazały, że miR-142 był wysoce eksprymowany w Próbki AML (ryc. S5B w dodatku uzupełniającym). Zmutowane allele miR-142 ulegały ekspresji na poziomach zbliżonych do alleli niezmutowanego allelu we wszystkich próbkach (ryc. S5C w dodatkowym dodatku). Chociaż mutacje miR-142 nie zostały wcześniej zidentyfikowane, kilka doniesień powiązało nieprawidłową ekspresję miR-142-3p z nowotworami hematologicznymi, w tym z prekursorową limfocytami B23 i komórkami T24,25 z ostrą białaczką limfoblastyczną i AML26. Pozostałe mutacje w miRNA geny zostały zlokalizowane na prekursorowych miRNA (w 3 próbkach) lub na niesezonowany region dojrzałego miRNA (w próbce). Warianty linii germinalnej
Zidentyfikowaliśmy wszystkie warianty, które mogą powodować skrócenie mRNA, które stwierdzono zarówno w próbkach skóry, jak i guza (patrz sekcja Wyniki, Tabela S11 i Rys. Jednakże okazało się, że bardzo niewiele genów z wariantami skróconymi ulega ekspresji w większości próbek AML (w tym w próbkach niosących same warianty), co sugeruje, że większość dziedziczonych skracających się wariantów prawdopodobnie nie ma znaczenia dla patogenezy.
Funkcjonalna kategoryzacja zmutowanych genów
Rysunek 2. Rysunek 2. Organizacja mutacji w kategorie pokrewnych genów. Pokazane są somatyczne, niesynonimowe mutacje w poszczególnych genach i zestawach genów, pogrupowane w dziewięć kategorii, w tym jedna kategoria pojedynczego genu, oznaczona etykietą po lewej stronie. Spośród 200 zbadanych próbek, 199 (> 99%) miało co najmniej jedną mutację w jednym z wymienionych genów lub zestawów. Niebieskie pola wskazują mutacje, które są wyłączne we wszystkich kategoriach; zielone skrzynki, mutacje, które współwystępują w tej samej próbce w różnych kategoriach; i pomarańczowe pudełka, mutacje, które współwystępują w tej samej próbce w tej samej kategorii. Analiza obliczeniowa z użyciem algorytmu Dendrix ++ zidentyfikowała trzy znaczące, wzajemnie wykluczające się grupy genów, z prawej strony oznaczone jako grupy A, B i C. Ryzyko cytogenetyczne dla każdego pacjenta przedstawiono na dole wykresu. Dodatkowe informacje na temat danych na tym rysunku znajdują się w tabelach od S17 do S20 w Dodatku uzupełniającym. Ser-Thr oznacza serynę-treoninę, czynnik transkrypcyjny TF i tyrozynę Tyr.
Zastosowaliśmy uzupełniające podejścia do identyfikacji kombinacji mutacji w próbkach; dla tej analizy rozważaliśmy tylko niesynonimowe mutacje (rysunek 2)
[więcej w: dentysta bielsko, belimumab, gabinet stomatologiczny zielona góra ]

Tags: , ,

Comments are closed.

Powiązane tematy z artykułem: belimumab dentysta bielsko gabinet stomatologiczny zielona góra