Dentysta Krakow
Uslugi dentystyczne w krakowie – stomatolog

Genomowe i epigenomiczne krajobrazy dorosłych z ostrą białaczką szpikową AD 4

Posted in Uncategorized  by admin
July 10th, 2018

Każdy dyskretny klaster VAF reprezentuje klon będący podstawą lub subklon z niego wyprowadzony.17,18 Próbki z jednym klonem mają tylko klony założycielskie, te z dwoma klonami mają klon zakładający i jeden klon subklonowy, te z trzema klonami mają klon zakładający i dwa subklony i tak dalej. Sekwencjonowanie Exome zdefiniowało zbyt mało mutacji, aby dokładnie zdefiniować subklony. Każda próbka zawierała dowód na istnienie pojedynczego klonu założycielskiego, a większość miała jeden lub więcej subklonów wywodzących się z klonu założycielskiego. Wyznacza się podtypy francusko-amerykańsko-brytyjskie (FAB) próbek. (Patrz Tabela dla podtypów FAB AML.) Próbki podzielono na 10 grup na podstawie obecności lub braku znanych powtarzających się zdarzeń fuzji, profilu ryzyka cytogenetycznego lub obecności lub braku mutacji TP53 (które były silnie związane z niekorzystnym ryzykiem cytogenetycznym) (Figura 1A). Zaobserwowaliśmy znaczące różnice w liczbie nawracających mutacji poziomu w niektórych z tych grup. Jedenaście próbek miało fuzje MLL; grupa ta miała najmniej powtarzające się mutacje poziomu 1, ze średnią 2,09, w porównaniu ze średnią 5,24 dla wszystkich 200 próbek (P = 0,002 po korekcie dla wielokrotnych porównań). To odkrycie sugeruje, że fuzje MLL wymagają mniej współpracujących mutacji niż inne zdarzenia inicjujące AML. Podobnie, 20 próbek zawierających fuzje PML-RARA miało mniej powtarzających się mutacji poziomu (średnia, 3,25; P = 0,001). Zaobserwowaliśmy wyższą średnią liczbę nawracających mutacji poziomu w 7 próbkach zawierających fuzje RUNX1-RUNX1T1 (średnia wartość, 7,85; P = 0,04) oraz w 13 próbkach z kombinacją wysokiego ryzyka profilu cytogenetycznego i mutacji TP53 (średnia 7,00; P = 0,049). Aby potwierdzić te obserwacje, wymagane będą większe zestawy próbek.
Łącznie 260 genów miało mutacje somatyczne w co najmniej 2 z 200 próbek; w 154 z tych genów więcej niż jedna mutacja była niesynonimowa. Znaleziono dodatkowe 1623 geny posiadające potwierdzoną mutację poziomu w jednej próbce. Używając znacząco zmutowanego genu (SMG) w zestawie narzędzi Mutational Significance in Cancer (MuSiC), 20 zidentyfikowaliśmy 23 geny o wyższej niż oczekiwano częstości występowania mutacji (stopa fałszywego wykrywania, <0,05), w tym geny, które są dobrze ustalone jako istotne dla patogenezy AML (np. DNMT3A, FLT3, NPM1, IDH1, IDH2 i CEBPA), wraz z genami, które dopiero niedawno były zaangażowane w patogenezę AML, w tym U2AF1, EZH2, SMC1A i SMC3 (Figura 1B, oraz tabela S7 w dodatkowym dodatku).
Zidentyfikowaliśmy i zweryfikowaliśmy wszystkie warianty w regionach niekodujących w 50 parach próbek, które analizowaliśmy przy użyciu sekwencjonowania całego genomu. Po wykluczeniu próbki guza z Pacjenta 817156, który miał wysoki poziom komórek nowotworowych AML (36%) w próbce skóry (Tabela S1 w dodatkowym dodatku), mediana liczby niekodujących mutacji w próbkach nowotworu wynosiła 394, od 68 do 1298
[podobne: implanty zielona góra, dentofobia, pokrowce antyroztoczowe ]

Tags: , ,

Comments are closed.

Powiązane tematy z artykułem: dentofobia implanty zielona góra pokrowce antyroztoczowe