Dentysta Krakow
Uslugi dentystyczne w krakowie – stomatolog

Genomowe i epigenomiczne krajobrazy dorosłych z ostrą białaczką szpikową AD 12

Posted in Uncategorized  by admin
July 9th, 2018

Geny definiujące grupy sekwencjonujące RNA i miRNA przedstawiono na Fig. S16 w Dodatkowym dodatku; bardzo uderzający zestaw małych genów RNA w odciśniętym locus na chromosomie 14 okazał się być konsekwentnie rozregulowany w ostrej białaczce promielocytowej (ryc. S17 w dodatkowym dodatku) .37 Dyskusja
Spośród dorosłych typów nowotworów, które do tej pory były w znacznym stopniu zsekwencjonowane, AML wykryło najmniej mutacji (ryc. S18 w dodatkowym dodatku). Średnia liczba mutacji kodujących (SNV i indel) na pacjenta w tym badaniu wynosiła 13, z których tylko 5 było mutacją nawracającą w każdym genomie. Niewiele dowodów na niestabilność genomu w większości genomów AML. Jednak niewielka liczba pacjentów miała profil cytogenetyczny niekorzystny pod względem ryzyka (złożonego), który był silnie związany z mutacjami w TP53, co potwierdziło niedawno zrelacjonowaną zależność.38 Dorosłe genomy AML zawierają medianę tylko jednego wariantu somatycznej liczby kopii i średnio mniej niż jedno zdarzenie związane z fuzją genu (na ogół spowodowane przez translokację) .1,2
Organizacja zmutowanych genów w dziewięć funkcjonalnie powiązanych kategorii ujawniła wiele potencjalnie ważnych związków biologicznych. Fuzje czynników transkrypcyjnych były pierwszymi rozpoznanymi mutacjami somatycznymi w genomach AML, 1,2 i wykazano, że wszystkie takie fuzje są istotne dla inicjacji choroby u myszy.39-42. Nasze dane pokazują, że niektóre mutacje są powszechne w AML (np. w DNMT3A, NPM1, CEPBA, IDH1 / 2 i RUNX1) wzajemnie się wykluczają fuzje czynników transkrypcyjnych, co sugeruje, że te mutacje mogą mieć funkcje w inicjacji AML, które są podobne do funkcji genów fuzyjnych. Zidentyfikowaliśmy również wzór wzajemnej wyłączności dla mutacji w genach w obrębie pewnych klas biologicznych, w tym tych kodujących kohezyny, białka spliceosomu, białek sygnałowych i białek modyfikujących histon, co sugeruje, że jedna mutacja w tych szlakach jest zasadniczo odpowiednia dla patogenezy AML. . Chociaż powszechny model patogenezy AML sugerował, że mutacja aktywująca w genie kodującym białko sygnalizacyjne może być wymogiem dla patogenezy, tylko 59% pacjentów w naszym badaniu miało mutację w genie opisywaną, aby zasugerować rolę w sygnalizacji. .
Zintegrowaliśmy dane dotyczące ekspresji dla mRNA i miRNA z wszystkimi danymi klinicznymi i mutacyjnymi dla wszystkich genomów. Analiza ta ujawniła, że stan zróżnicowania próbki AML był silnie skorelowany z sygnaturą ekspresji, jak podano wcześniej.44 Pacjenci, którzy mieli fuzje PML-RARA, mieli bardzo wyraźne sygnatury mRNA i miRNA, które były silnie skorelowane ze sobą iz określonym DNA. Oznaka metylacji.45 Wszystkie fuzje czynników transkrypcyjnych korelowały ze specyficznymi wzorcami ekspresji mRNA, podczas gdy PML-RARA i RUNX1-RUNX1T1 (i niektóre fuzje MLL) były również związane z sygnaturami ekspresji miRNA
[więcej w: dentysta olsztyn, implanty zielona góra, implanty zębów Kraków ]

Tags: , ,

Comments are closed.

Powiązane tematy z artykułem: dentysta olsztyn implanty zębów Kraków implanty zielona góra